液肥栽培に比べて2.6倍の生産性

水耕栽培は通常「液肥」と呼ばれる化学肥料を使って栽培を行いますが、例えば5000円で購入できる水耕栽培の「液肥」約4kgに対して、アクアポニックスでは魚の排泄物が肥料となるため、魚を育てる餌を肥料と仮定した場合、約23kgの餌を購入することができます。
また、アクアポニックスの餌代はあくまでも魚の養殖のために必要なコストであり、野菜の栽培に直接かかる肥料代は0円とも言えます。このことからも、アクアポニックスが既存の植物工場に比べて高い生産効率を誇ることが分かります。